Mạch khuôn của gen có trình tự nuclêôtit là một chuỗi các nuclêôtit được liên kết với nhau để tạo thành một cặp mạch khuôn. Mỗi nuclêôtit trong mạch khuôn của gen được biểu diễn bằng một ký tự đặc biệt, và các ký tự này được sắp xếp theo trình tự cụ thể. Trình tự này có thể được sử dụng để xác định các thành phần của gen, và cũng có thể được sử dụng để xác định các tính chất của gen.